Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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