Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14-2A0A075B694 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms