Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scamp5Q9JKD3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms