Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chmp4bQ9D8B3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms