Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn23Q9D7D7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn23Q9D7D7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms