Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms