Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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