Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd49Q8VE42 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ankrd49Q8VE42 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms