Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms