Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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