Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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