Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Snx17Q8BVL3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx17Q8BVL3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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