Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem39bQ810L4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms