Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Zbed4Q80WQ9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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