Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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