Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Miga1Q4QQM5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms