Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arfgef3Q3UGY8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms