Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ptcd3Q14C51 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms