Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms