Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms