Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms