Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mmp11Q02853 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mmp11Q02853 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mmp11Q02853 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Mmp11Q02853 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Mmp11Q02853 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Mmp11Q02853 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mmp11Q02853 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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