Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms