Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms