Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms