Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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