Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18529 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18529 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18529 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18529 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18529 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms