Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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