Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5108J3QP01 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms