Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms