Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubxn8Q9QZ49 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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