Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2cQ9D1C1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms