Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nip7Q9CXK8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms