Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms