Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp3Q91W36 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp3Q91W36 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms