Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms