Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lrrtm1Q8K377 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms