Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms