Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfcQ8CI19 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms