Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms