Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbfox3Q8BIF2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbfox3Q8BIF2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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