Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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