Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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