Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm5dQ62240 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms