Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed1Q3V009 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms