Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms