Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms