Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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