Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms