Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SrprbP47758 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SrprbP47758 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrprbP47758 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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